記事のアーカイブ

2020年06月19日 13:44

【Takahashi et al. (2018) マコガレイ成魚の摂食日周性と日間摂食量】

著者:Satoshi Takahashi, Yutaka Kurita, Hiroyuki Togashi, Takeshi Tomiyama題目:Diel feeding rhythms, daily ration, and seasonal changes thereof in marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae掲載誌:Journal of Applied Ichthyology 34: 888-895...
2020年06月19日 13:40

【Okamoto et al. (2018) ミャンマーのタチウオ類の分類】

著者:Naohiro Okamoto, Maung-Saw-Htoo-Thaw, Sein-Thaung, Kazuhiko Koike, Jun-ya Shibata, Takeshi Tomiyama題目:Species composition of hairtails (Trichiuridae) in Myanmar掲載誌:Regional Studies in Marine Science 17: 73-77 (2018)...
2020年06月19日 13:32

【Shigematsu et al. (2017) 瀬戸内海冬季のイカナゴ等仔魚の分布とサイズ】

著者:Yuya Shigematsu, Yuichiro Ochi, Shuhei Yamaguchi, Kazumitsu Nakaguchi, Yoichi Sakai, Jun-ya Shibata, Wataru Nishijima, Takeshi Tomiyama題目:Winter longitudinal variation in the body size of larval fishes in the Seto Inland Sea, Japan掲載誌:Fisheries Science 83: 373-382 (2017)...
2020年06月19日 13:24

【Kusakabe et al. (2017) マコガレイ稚魚の水温と成長】

著者:Kazushi Kusakabe, Masaki Hata, Jun Shoji, Masakazu Hori, Takeshi Tomiyama題目:Effects of water temperature on feeding and growth of juvenile marbled flounder Pseudopleuronectes yokohamae under laboratory conditions: evaluation by group- and individual-based methods. 掲載誌:Fisheries Science 83:...
2020年06月18日 18:26

【Yoshida et al. (2017) 瀬戸内海のサキグロタマツメタの分布とサイズ】

著者:Kazuki Yoshida, Tatsuma Sato, Kaoru Narita, Takeshi Tomiyama題目:Abundance and body size of the moonsnail Laguncula pulchella in the Misuji River estuary, Seto Inland Sea, Japan: comparison with a population in northern Japan掲載誌:Plankton and Benthos Research 12: 53-60...
2020年04月08日 18:34

生データから誤差線付きの折れ線グラフ

生データから折れ線グラフを作成します。こんな図を作る手順です。今回もRに予め用意されているデータセット「ToothGrowth」を使ってやってみます。Rを立ち上げて「ToothGrowth」と入力すると、以下のデータが出てきます。    len supp dose1   4.2   VC  0.52  11.5   VC  0.53   7.3   VC  0.54   5.8  ...
2019年10月18日 11:18

箱ひげ図のx軸の並び替え

箱ひげ図で、x軸がカテゴリー変数の場合、デフォルトでは数字順やアルファベット順になります。しかし、自分の好みで並び替えたり抽出したりすることができます。Rに予め用意されているデータセット(InsectSprays)を使ってみます。> boxplot(count ~ spray, data = InsectSprays)このうち、AとCだけを抽出してC、Aの順に並べる図を作ってみます。> boxplot(count~factor(spray, levels=c("C","A")),...
2019年07月13日 06:38

図に変な線が入る問題

Windowsで起こる問題のようですが、ちょっと困ったことがありました。Rで作図してメタファイルとしてコピーし、MS-PowerPointやMS-Wordに貼り付けると、変な線が入ることがあります。以前に作った図をメタファイルとしてPowerPointに貼ってみます。作図コマンドはこちら。> boxplot(count ~ spray, data =...
2019年02月28日 14:22

2要因の箱ひげ図

Rは箱ひげ図を描くのにとても便利です。ここでは2要因の箱ひげ図を描く場合をとりあげます。 まずは1要因の箱ひげ図から。Rに予め用意されているデータセット(InsectSprays)を使ってみます。データセットはsprayの種類ごとにカウントデータが12個ずつあります。データ数は以下のコマンドで確認できます。> summary(InsectSprays)     count       spray  Min.   : 0.00  ...
2019年02月04日 08:58

誤差線を表示

グラフを書くときに、誤差線(エラーバー)を表示したいことがあります。平均値±標準偏差、といった表示に加えて、正あるいは負のみを表示したい場合にどうするかを取りあげたいと思います。(注)こちらのページを参考にしています。Rにもともと入っているデータセット(iris)を使ってやってみます。> iris.mean <- tapply(iris$Sepal.Length, iris$Species, mean) #Speciesという項目ごとにSepal.Lengthの平均値を求めます> iris.sd <- tapply(iris$Sepal.Length,...

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